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转录组研究原料解决方案,全在这里

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2024-12-03T00:00 (访问量:19123)

全转录组研究

 

【全转录组测序—研究非编码RNA与mRNA间的靶向调控以及相互作用关系】

全转录组高通量测序,采用去核糖体链特异性建库方法和小片段富集筛选建库方法,可实现编码RNA和非编码RNA的建库、测序、信息分析及联合分析、ceRNA等,从而快速全面准确地获得与特定生物学过程 (例如发育、疾病等)所有RNA转录本数据信息,通过数据分析将生物调控机制研究延伸到“ 网、多层面”结合的立体模式,有助于相对全面解读生物学现象。

 

全转录组测序有两种方式,一种是LncRNA-Seq + Small RNA,另一种是LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA,可以更加全面的获取CircRNA的信息。

· 

两种文库的全转录组测序:LncRNA-Seq + Small RNA;

· 

三种文库的全转录组测序:LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA。

· 

 

全转录组技术路线

 

全转录组研究原料解决方案

 

 

动物类

植物类

细菌真菌类

样本类型

动物组织/细胞

细胞

全血

植物组织

真菌组织

培养的细菌和真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606
柱式法:19221/19211
Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604
柱式法:19231

柱式法:19241
Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

柱式法:19301(真菌需要加溶壁酶10403)

miRNA提取

柱式法:19331

柱式法:19331

柱式法:19332

柱式法:19331

miRNA文库构建

敬请期待

rRNA去除

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人源去除)
磁珠法去除:12266(哺乳动物通用型)/12267鸟类通用型/12268家鸡/12269斑马鱼/12270果蝇 /12275牡蛎/12278涡虫/12285蜜蜂/12286横纹金蛛/12289蜱虫/12290白纹伊蚊/12287线虫

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人去除,适合病原)

RNaseH酶法去除,包含去除珠蛋白:12257+12806

RNaseH酶法去除珠蛋白:13572
3 min快速去除:12258+12260

RNaseH酶法去除:12254
磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264细菌通用型/12265原核生物通用型

文库构建

非预混RNA建库试剂盒:12308双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)
预混版RNA建库试剂盒:12310双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放线菌素D,dUTP)/12341(不含放线菌素D,dTTP)

 

 

LncRNA研究

 

长链非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNA)是近年来引起广泛关注的一种具有独特的调控功能的非编码RNA。LncRNA的长度在200nt以上,不编码蛋白,物种间保守性较差,有的序列结构与mRNA相似(含有polyA尾,存在可变剪切),有的则无这些特征。目前的研究对LncRNA的产生和功能机制尚未有明确的认识,但已有多种具有重要生物功能(如癌症发生、X染色体沉默以及与其他调控因子作用构成复杂调控网络等)的LncRNA被发现。

 

LncRNA测序技术路线

LncRNA测序原料解决方案

 

 

动物类

植物类

细菌真菌类

样本类型

动物组织/细胞

细胞

全血

植物组织

真菌组织

培养的细菌和真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606
柱式法:19221/19211
Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604
柱式法:19231

柱式法:19241
Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

柱式法:19301(真菌需要加溶壁酶10403)

rRNA去除

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人源去除)
磁珠法去除:12266(哺乳动物通用型)/12267鸟类通用型/12268家鸡/12269斑马鱼/12270果蝇 /12275牡蛎/12278涡虫/12285蜜蜂/12286横纹金蛛/12289蜱虫/12290白纹伊蚊/12287线虫

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人去除,适合病原)

RNaseH酶法去除,包含去除珠蛋白:12257+12806

RNaseH酶法去除珠蛋白:13572
3 min快速去除:12258+12260

RNaseH酶法去除:12254
磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264细菌通用型/12265原核生物通用型

文库构建

非预混RNA建库试剂盒:12308双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)
预混版RNA建库试剂盒:12310双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放线菌素D,dUTP)

 

 

真核转录组研究

 

真核转录组研究,通过RNA-seq技术获得特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的mRNA的总和,随后对下机的原始数据进行拼接组装,对基因的表达量进行统计,并进行差异分析和功能富集分析。既能获得该物种绝大部分基因信息又能从整体水平研究基因表达差异及功能通路变化,揭示特定生物学过程的分子机制。

真核转录组测序技术路线

 

真核转录组测序原料解决方案

 

 

动物类

植物类

真菌类

样本类型

动物组织/细胞

细胞

全血

植物组织

真菌组织

培养的真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606
柱式法:19221/19211
Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604
柱式法:19231

柱式法:19241
Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

柱式法:19301(加溶壁酶10403)

mRNA捕获

12629 mRNA Isolation Master Kit

文库构建

非预混RNA建库试剂盒:12308双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)

非预混RNA建库试剂盒-含mRNA捕获:12309双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)
预混版RNA建库试剂盒:12310双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放线菌素D,dUTP)

 

 

circRNA研究

 

【circRNA测序—研究circRNA的差异表达如何影响生物学过程】

环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类特殊的非编码RNA分析,测序采用测序平台进行测序,针对有参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定以及来源基因的分析, 环状RNA测序在医学、农学研究领域应用越来越广泛。基于高通量测序,依据主流数据库和circRNA鉴定软件,分析项目物种的circRNA信息,深入挖掘circRNA在转录调控中所发挥的重要功能。

circRNA测序技术路线

circRNA研究原料解决方案

 

 

动物类

植物类

细菌真菌类

样本类型

动物组织/细胞

细胞

全血

植物组织

真菌组织

培养的细菌和真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606
柱式法:19221/19211
Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604
柱式法:19231

柱式法:19241
Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

柱式法:19301(真菌需要加溶壁酶10403)

rRNA去除

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人源去除)
磁珠法去除:12266(哺乳动物通用型)/12267鸟类通用型/12268家鸡/12269斑马鱼/12270果蝇 /12275牡蛎/12278涡虫/12285蜜蜂/12286横纹金蛛/12289蜱虫/12290白纹伊蚊/12287线虫

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人去除,适合病原)

RNaseH酶法去除,包含去除珠蛋白:12257+12806

RNaseH酶法去除珠蛋白:13572
3 min快速去除:12258+12260

RNaseH酶法去除:12254
磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264细菌通用型/12265原核生物通用型

线性RNA消化

14606 RNase R 去除线性RNA分子

文库构建

非预混RNA建库试剂盒:12308双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)
预混版RNA建库试剂盒:12310双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放线菌素D,dUTP)

 

 

宏转录组

 

【宏转录组—捕捉微生态微环境活性微生物动态变化】

宏转录组测序:(Metatranscriptome Sequencing/ Metatranscriptomics)从整体水平研究特定环境中所有群体基因组转录情况和调控规律,以微生态微环境中全部RNA为研究对象, 结合高通量测序从转录水平研究复杂微生物群落变化,挖掘发挥功能的活性基因。

宏转录组研究原料解决方案

 

样本类型

培养的细菌和真菌

临床样本

RNA提取

柱式法:19301(真菌需要加溶壁酶10403)

柱式法:19321(病毒DNA/RNA提取)

磁珠法:18521(病毒DNA/RNA提取)

18306(病原DNA/RNA提取)

rRNA去除

3 min快速去除:12258(人源去除)

文库构建

方案1. Total RNA建库: 12308ES双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)

方案2. cDNA酶切建库:13488ES cDNA合成模块+12316ES 快速酶切法建库试剂盒

 

 

产品推荐

 

产品名称

货号

规格

Hieff NGS ® EvoMax RNA Library Prep Kit(dUTP)
链特异性预混版total RNA建库试剂盒(不含放线菌素D)

12340ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit(dNTP) 预装板RNA建库试剂盒(不含放线菌素D)

12341ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)

12308ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version)
预混版total RNA建库试剂盒(含放线菌素D)

12310ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit V2
 mRNA纯化试剂盒V2

12629ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)
人/小鼠/大鼠核糖体RNA去除试剂盒

12257ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit(Plant)
植物核糖体RNA去除试剂盒

12254ES24/96

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Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit(Human,100-1,000 ng) 一步快速去除核糖体RNA试剂盒(人)

12258ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Bacteria(G- and G+)) with purification beads
细菌核糖体RNA去除试剂盒

12264ES24/96

24 T/ 96 T

 

 

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